新闻网讯 近日,第三届基因组育种算法国际竞赛颁奖典礼在华中农业大学举行。我校动科学院杜志强教授指导的Gene Cube团队凭借自主研发的GEMKC模型,在全球42支参赛队伍的激烈角逐中脱颖而出,以最高分夺得比赛唯一二等奖(一等奖空缺)。

本次竞赛以“基因组育种‘从算法到应用’”为主题,由华中农业大学联合国家玉米种业技术创新中心、玉米等作物种质创新及分子育种全国重点实验室主办,崖州湾国家实验室、上海人工智能实验室、华为技术有限公司等单位协办。赛事首次引入中国种子集团提供的真实育种场景数据集——涵盖9600余个玉米杂交种、16000个分子标记的实测数据,并增设田间验证环节,构建“算法开发-模拟测试-田间验证”全链条评价体系。
Gene Cube团队由谭涛涛负责,成员包括宋宇、姚棟斌、胡璇琪、张思源。团队创新研发基于KAN与CNN的多模态模型GEMKC,融合CNN与KAN网络,分别处理高维基因型数据与低维环境变量,实现基因型-环境交互效应的高效建模。在数据处理阶段,团队提出基于同胞信息的基因型填充策略,修复约1691万个缺失位点,并采用ATCG四通道编码提升SNP表征能力。该模型通过Optuna自动调优,对5700个样本的预测仅需5~7秒,兼具高精度、快速度与一定可解释性,达到与组委会基准模型高度接近的预测准确率,获评委一致认可。
经过激烈角逐,我校动科学院Gene Cube团队获得二等奖,华中农业大学GS-Farmer团队和华南农业大学EPGS团队并列获得三等奖,四川农业大学MaizeMind团队获得优胜奖。
据悉,本届竞赛自2025年5月启动以来,吸引了包括伦敦大学学院在内的国内外多所高校和研究机构的42支队伍报名参赛。最终,来自长江大学、华中农业大学、华南农业大学、四川农业大学和上海交通大学的5支队伍晋级决赛答辩环节。(动科学院供稿)
(审核 张娟 编辑 杨云锋)